Lãnh đạo qua các thời kỳ:

- Tổng cục trưởng: PGS.TS Nguyễn Văn Cư, TS. Nguyễn Thành Minh

- Phó Tổng cục trưởng: PGS.TS Nguyễn Chu Hồi, Nguyễn Đăng Đạo, Phạm Ngọc Sơn,Vũ Sĩ Tuấn

Lãnh đạo đương nhiệm

- Tổng cục trưởng: Ông Tạ Đình Thi

- Các Phó Tổng cục trưởng: Vũ Trường Sơn, Phạm Thu Hằng, Nguyễn Quế Lâm.